岳阳仲裁委员会的日常办事机构为岳阳仲裁委员会秘书处，系岳阳市司法局直属事业单位，现有秘书长，副秘书长，综合管理室，案件受理室，案件审理室。
秘书长
主持岳阳仲裁委员会秘书处全面工作，负责与岳阳仲裁委员会领导班子的联络沟通。
副秘书长
负责所分管工作，协助秘书长处理秘书处日常事务，统筹指导综合性工作开展，把关仲裁案件的受理及审理。
综合管理室
负责秘书处日常运转、对外交流合作和综合协调工作，承担文稿起草、党建、新闻宣传、对外交流、财务、人事、机要保密、档案、后勤服务等各项管理工作；建立健全秘书处各项管理工作流程及制度并贯彻执行，组织策划培训等各项活动；负责本委主任交办的其他工作。
案件受理室
负责仲裁案件的咨询、受理工作，对案件进行审查立案登记；负责案号编制、分配、仲裁案件费用预收的计算、已缴费案件及缓减免案件的报批；负责涉及民生等简易案件的受理前调解；定期统计并分析案件受理情况，研究受理工作出现的新情况、新问题；负责受理大厅、受理窗口的日常管理。
案件审理室
负责仲裁案件审理的程序管理，制定修改仲裁规则；组织仲裁理论与实务研究；落实岳阳仲裁委员会秘书处仲裁案件核阅制度、专家咨询制度并做好服务保障，进行仲裁案件的质量督查；负责信访投诉等事务性工作；仲裁案卷归档管理；负责仲裁秘书的日常管理，以及仲裁员的日常联络、履职考评等相关工作。